Ich habe je auch geschrieben "je nach Kategorie/Kette". Weiß ja nicht in welcher Kategorie Du wohnen möchtest, aber z.B. Super8, La Quinta Inn bieten einen Bestpreisgarantie auf deren Homepage an.
Vielleicht ist ja NY ein schlechtes Beispiel, Du hast ja auch nicht geschrieben wann und wohin Du hinwillst. Und natürlich können die Hotels mal Specials für bestimmte Anbieter rausrücken...
Möglicherweise hängt der Preisunterschied auch mit unterschiedlichen Zimmerkategorien zusammen...
Ich habe mal 3 Tage im Mai in Pennslyvania gesteste, der Endpreis dürfte nach Gebühren auf beiden Seiten ziemlich identisch sein... Leider werden die Gebühren für hotels.com nicht klar ausgewiesen (müßte meines Wissens aber so sein).
Da hotels.com lt. eigenen Angaben in den Hotels Kontingente hat, kann es durchaus sein, daß das Hotel direkt ausgebucht ist, hotels.com aber noch Zimmer zur Verfügung hat.