Um die Natur zu sehen, helfen Inlandsflüge auch nicht unbedingt weiter, da du ja auf jeden Fall vom Flughafen zum Nationalpark wieder ein Auto brauchst.
Die einzige sinnvolle Kombination aus Auto und Flug sehe ich darin, wenn man nur zwei Wochen Zeit hat und sich dei Einwegmiete ersparen will, nach Las Vegas oder LA zu fliegen und von dort eine Tour durhc den Südwesten zu drehen, z.B.
Los Angeles - Joshua Tree - Grand Canyon - Page - Monument Valley - Moab - Capitol Reef - Bryce Canyon - Zion - Las Vegas (zwischen LA und LV werden bei den meisten Autovermietungen keine Einwegmieten verlangt)
Andererseits darf man aber auch nicht vergessen, dass man zwar die Einwegmiete spart, dafür aber wieder den Inlandsflug zahlen muss.
Wer außerdem noch gerne ein paar Berge sieht, Passstraßen mag etc., der sollte sich ruhig schon in Colorado hinter's Lenkrad klemmen und so wie GreyWolf beschrieben hat on Tour gehen, ggf. kleine Abweichungen je nach Geschmack.