Also als "Vielfahrer" mal noch einen Kommentar dazu: Bei unserer letzten Tour im Südwesten hatten wir genau das gleiche Problem mit der gleichen Route.
Erstmal ging es natürlich früh los von Phoenix (erster Tag, da wird man ja eh früh wach.) Und dann Richtung Sedona. Nun dachte ich mir, dass nur über den Highway (Interstate?) 17 ist das bisschen schnell und bin dann Richtung Prescott abgebogen und durch die Berge nach Sedona. Das hat sich dann sehr gezogen, landschaftlich eine schöne Strecke, aber doch wirklich viele, viele Kurven.
Also, die Berge westlich von der Interstate kosten viel Zeit. Es hängt also ein bisschen davon ab, was Du noch an dem Tag machen willst. Wenn Du wirklich nur bis Flagstaff willst und nix in der Umgebung (Petrified Forest, Meteor Crater oder so), dann ist die Strecke okay und Du hast noch genug Zeit in Sedona.
Ansonsten von Flagstaff würde ich unbedingt über die 89 und dann möglichst früh am Morgen Sunset Crater NM anschauen, den Lava Flow Trail (1-2 Stunden). Bei schönem Wetter ist das klasse.
Der weitere Weg über Wupatki ist nicht hundertprozentig nötig, wenn Du es eilig hast, würde ich dann doch über den 89 weiterfahren, damit Du zügig am Grand Canyon bist.