Wenn Du viel Zeit hast, kannst Du ja beides ansehen. Wenn nicht - einfach am Osteingang rein, über den Tioga Pass bis zum Yosemite Valley (dort alles besichtigen was Dich interesssiert), weiter Richtung Oakhurst (davor evtl. Abstecher nach Glacier Point), dort Mariposa Grove besichtigen. Auch dort stehen sehr imposante Giant Sequoias, so dass Du Dir dann ggf. den kompleten Trip zum Sequoia NP sparen kannst.
Evtl. in Oakhurst übernachten, tags darauf durch den Westeingang raus aus dem Park und Richtung San Francisco weiter. So würd's ich machen.