Hier meine Vorschläge für die Zeit in NYC:
1. halber Tag:
Fahrt mit der U-Bahn rüber in den Financial District von Manhattan. Dein Hotel liegt leider arg weit drin in Brooklyn, sonst wäre ein Walk rüber über die Brooklyn Bridge empfehenswert. Im Financial District je nach Interesse: Ground Zero, Wall Street, Battery Park oder Fähre zur Freiheitsstatue (ansonsten nur von Weitem einen Blick drauf werfen)
Danach U-Bahn nach Uptown und hoch auf die Aussichtsplattform Top of the Rock (Rockefeller Center/GE Building). Am besten so, dass Du den Sonnenuntergang oben erlebst.
2. voller Tag:
Fahrt rüber zum Columbus Circle und von dort in den Central Park reinlaufen, aber nicht zu weit nach Norden, sondern eher quer durch und auf der Fifth Avenue/Grand Army Plaza wieder raus. Das reicht für einen ersten Eindruck. Von dort Walk durch Midtown: Fifth Avenue, Rockefeller Center, Park Avenue, Grand Central Terminal, Empire State Building, 6th Avenue und gegen Abend: Broadway/Times Square.
3. halber Tag:
U-Bahn-Fahrt rüber ins Village und/oder SoHo und/oder Chinatown - einfach, um mal zu sehen, dass Manhattan nicht nur aus Hochhäusern besteht und welch andere Stimmung hier herrscht
Es ist alles machbar, aber Du musst Dich ein wenig ranhalten oder Du kippst was raus. Leider wird Dich die Fahrerei einiges an Zeit kosten, da Du in Brooklyn wohnst und die Highlights nun mal in Manhattan liegen. Die G-Linie, die nahe Deinem Hostel fährt, fährt nicht non-stop rüber. Du musst immer 1 bis 2 Mal umsteigen.
Bezüglich der Transporation nach JFK schau Dich hier mal um:
http://www.panynj.gov/aviation/jgtsmain.htm oder frage die Leute im Hostel gleich am ersten Tag, was die beste Variante ist.
VIEL SPASS!